Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rb1cc1Q9ESK9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rb1cc1Q9ESK9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms