Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms