Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Capn12Q9ER56 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms