Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tlr1Q9EPQ1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms