Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms