Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Csnk1dQ9DC28 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Csnk1dQ9DC28 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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