Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pop5Q9DB28 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms