Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tmem239Q9DA47 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem239Q9DA47 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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