Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cnot8Q9D8X5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cnot8Q9D8X5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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