Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q9D8N1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms