Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Capns2Q9D7J7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms