Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc94Q9D6J3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms