Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrp2bpQ9D4C6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms