Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syce1Q9D495 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms