Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim42Q9D2H5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim42Q9D2H5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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