Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krtap5-3Q9D226 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krtap5-3Q9D226 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms