Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.33□□□□□ -0.75
Mrpl53Q9D1H8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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