Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mrpl28Q9D1B9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms