Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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