Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Shisa9Q9CZN4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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