Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xrcc3Q9CXE6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms