Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpusd4Q9CWX4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpusd4Q9CWX4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Rpusd4Q9CWX4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpusd4Q9CWX4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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