Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prps2Q9CS42 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms