Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q9CRC3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q9CRC3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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