Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Smim8Q9CQQ0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms