Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccer1Q9CQL2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccer1Q9CQL2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms