Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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Use1Q9CQ56 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Use1Q9CQ56 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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