Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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