Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cntnap4Q99P47 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cntnap4Q99P47 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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