Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrapQ99MP8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms