Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms