Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pagr1aQ99L02 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms