Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apobec3Q99J72 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms