Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ctu1Q99J10 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctu1Q99J10 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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