Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
SptssbQ925E8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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