Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Spdl1Q923A2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms