Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tubb6Q922F4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms