Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smc1bQ920F6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms