Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Med28Q920D3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Med28Q920D3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms