Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atl3Q91YH5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms