Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms