Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam20bQ8VCS3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Fam20bQ8VCS3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fam20bQ8VCS3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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