Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms