Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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SbsnQ8CIT9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsnQ8CIT9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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