Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms