Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Csnka2ipQ8CH19 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Csnka2ipQ8CH19 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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