Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ercc8Q8CFD5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms