Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx8Q8CFD4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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