Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkl1Q8CEQ0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms