Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4aQ8C9S8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms